自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
铜人鍼灸经
增订医方歌诀
杂症会心录
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
卷之一上草部（山草类）人参珠儿参会兰参潞党参西洋参东洋参高丽参北沙参桔梗甘草葳蕤黄精黄蓍白术苍术天麻秦艽柴胡银州柴胡前胡川独活川独活川独活川独活北细辛远志金毛狗脊淫羊霍巴戟天琐阳肉苁蓉肥白芨参三七地榆
卷首序奏玉帝青辞进医书表卷上当明经络须识扶阳住世之法大病宜灸三世扁鹊时医三错忌用转下禁戒寒凉要知缓急五等虚实黄帝灸法扁鹊灸法附∶窦材灸法卷中伤寒伤寒四经见证太阳见证阳明见证太阴见证少阴见证伤风伤寒挟食
序一序二序三总论伤寒热病总论验舌色论验口唇论验二便论辨脉论南北方宜发表不同论南北方宜清里相同论三阴经热病论三阴经寒病论阴症似阳论阳症似阴论宜发表论忌发表论宜清里论忌清里论宜和解论忌和解论宜吐法论忌吐法
序叙论痈疽发背第一服药通变方第二荣卫返魂汤用敷贴温药第三冲和仙膏敷贴热药第四回阳玉龙膏敷贴凉药第五洪宝丹合用诸方第六黄矾丸柞木饮子三石散栝蒌散真君妙贴散追风丸搜损寻痛丸复煎散神锋散乌金散索血散葛根汤散
程门雪遗稿